一、为支持长大，长沙市科技局每年将科研经费打包给长大，2005年为100万元，前年（2010年）达260万元，去年（2011年）高达300万元。科研经费到校后，刘耘独断专横，暗箱操作，无视学术评审制度、财务监管制度和集体决策制度，一个人说了算，除个人分得多个项目金额大几十万元外，其余完全以刘耘个人好恶来决断，几百上千万的公款，就这样被刘耘瓜分。有人透露，为纠正刘耘的行径，市科技局2012年已收回这一支持了长大多年的政策。
　　二、2011年7月11日，湖南省市纪委联合调查组宣布：“刘耘近年来承担的科研项目共11项，累计经费共138。8万元，已支出89。5万元，余额49。3万元。经审计存在以下几个问题：（1）擅自违规发放用作奖金 ；（2）部分大额发票没有附上清单 ；（3）发票涉及内容与科技单位规定的使用范围不符 ；（4）违反财务管理，大额经费用现金支付。”长大科研经费公款私用，其最大食利者就是刘耘！
　　三、实名举报并查实（2008年9月17日，票据249号凭证）：刘耘从其主持的长沙市科研课题“长沙市公共管理创新平台建设研究”报销19张发票，每张发票背后都有经手人周湘莲和刘耘亲笔签名，由李××报销并领取现金，现金交给刘耘。总共一次性报销出73750元。其中71376元是空白发票套现所得。
　　科研经费来自财政，是百分之百的公款！一校之长刘耘，知法犯法、以权谋私，发票套现、侵吞公款，权力腐败、学术腐败加道德败坏。真不知道天底下还有没有比他更腐败更恶劣的校长！