药业有限公司建成投产后，由于布局不合理，处于城市上风向，异味扰民等问题长期受到群众举报。2013年以来，自治区各级环境保护部门共收到关于北方药业的投诉达143件，且呈逐年增多趋势。在此期间，自治区、呼伦贝尔和牙克石三级环境保护部门对北方药业实施行政处罚29次，都未能解决该企业异味扰民的问题。